Pengeluar pinggan mangkuk kayu juga memerlukan teknologi perlindungan dalam proses pemprosesan, kerana bahan pinggan mangkuk kayu terutamanya kayu. Jika ia tidak dilindungi, ia mudah reput dan berkulat di bawah hakisan air, minyak dan makanan.
Oleh itu, langkah-langkah mesti diambil untuk melindungi permukaan pinggan mangkuk kayu, tetapi perlu diperhatikan bahawa formaldehid dan benzena, yang berbahaya kepada tubuh manusia, tidak boleh digunakan pada pinggan mangkuk kayu. Secara amnya, bahagian luar pinggan mangkuk akan dicat dengan cat hijau atau minyak lilin kayu dan produk mesra alam yang lain. Malah cat mesra alam tidak boleh dicat di bahagian dalam pinggan mangkuk kayu yang bersentuhan dengan makanan, Bahagian dalam banyak pinggan mangkuk dilindungi oleh minyak yang boleh dimakan seperti minyak zaitun.
Kayu lembut mudah menyerap air. Cuba jangan gunakan pinggan mangkuk yang diproses daripada kayu tersebut. Akan ada cendawan di dalam pinggan mangkuk dari semasa ke semasa.